Quando non sono in corso grandi mostre, negli spazi espositivi di BLU | Palazzo d'Arte e Cultura, vengono allestite le Mostre Dossier, iniziative che si propongono di illustrare momenti significativi dell'arte e della storia di Pisa e del suo territorio.
Talvolta esse hanno avuto per oggetto artisti pisani: Umberto Vittorini (gennaio/febbraio 2009), Federigo Severini. Pittura e architettura (marzo 2009), Ferruccio Pizzanelli. Pittura e arti applicate (febbraio/marzo 2010), talaltra, come nel caso di I ritratti Roncioni. Una famiglia pisana e la pittura fra XVIII e XIX secolo (marzo/aprile 2010), opere e nuove acquisizioni importanti della Collezione della Fondazione.
Le Mostre Dossier sono ad ingresso gratuito e sono illustrate da un loro catalogo reperibile all’ingresso.