L'attività di BLU per affermarsi come centro di manifestazioni culturali di livello nazionale e contribuire allo sviluppo dell'economia del territorio, si svolge sull'intero arco dell'anno su due linee principali:
Per gestire tali attività la Fondazione ha stabilito una collaborazione con GAMM, società specializzata in questo settore appartenente al Gruppo Giunti di Firenze.
In questo ultimo ambito rientra la mostra "Chagall e il Mediterraneo" prima di un ciclo di iniziative che illustreranno alcuni grandi pittori che hanno operato nel Novecento sulle rive di questo mare, nel quale Pisa è stata per secoli protagonista e che tanto ha influenzato la sua arte e la sua cultura.
L'entrata delle mostre temporanee è dal grande ingresso monumentale del Palazzo che si affaccia sul lungarno, nel quale è posta la biglietteria e dal quale si accede anche al guardaroba, alla caffetteria ed all'esposizione permanente della Collezione della Fondazione.
Le sale di esposizione si snodano su un percorso vario ed articolato, al piano terreno ed al primo piano dell'ala est del palazzo e delle antiche scuderie. Gli ambienti sono dotati d'impianti di climatizzazione e trattamento dell'aria che assicurano il benessere dei visitatori e condizioni adeguate alla conservazione delle opere esposte.
L'accesso ai disabili è garantito in tutte le sale sia esposizione; per alcune sale possono essere presenti percorsi alternativi in funzione dell'allestimento.
Testi, didascalie ed audio-guide in italiano ed inglese rendono i contenuti comprensibili alle diverse fasce d'utenza; vengono inoltre organizzati laboratori didattici per classi scolastiche di ogni livello.
In occasioni delle grandi mostre il palazzo è dotato di un bookshop nel quale è possibile trovare pubblicazioni storico-artistiche insieme ai cataloghi delle mostre organizzate a palazzo.
Le Mostre Dossier si tengono di solito nella biblioteca del vecchio Palazzo accessibile dall'ingresso principale